Las herramientas CAPFITOGEN3 se actualizan

Durante esta semana se ha puesto a disposición de los usuarios una actualización de los scripts (o programación) de las herramientas CAPFITOGEN3 con varias novedades.

Esta actualización era en parte necesaria, ya que los paquetes de R denominados rgdal, rgeos y maptools, de mucha importancia en el funcionamiento de muchas herramientas, fueron retirados de R, teniéndose que reemplazar sus funciones por otras similares que proveen otros paquetes de R. Anteriormente, los usuarios tenían que adicionar en la libreria los paquetes de R antiguos o descatalogados en su instalación de R local, lo cual generaba bastante complejidad y errores en la instalación y funcionamiento de R y de las herramientas CAPFITOGEN3. Por esta razón, también se debía trabajar con versiones anteriores de R, no la más actual, lo cual también generaba problemas.

Así, se puede listar una serie de ventajas que tiene la nueva versión actualizada de CAPFITOGEN3. Entre ellas:

• Ahora se puede trabajar los scripts con la última versión de R que haya disponible o cualquiera relativamente reciente que tenga el usuario instalada en su computadora.
• Para utilizar los scripts CAPFITOGEN3 sólo es necesario instalar R y correr los scripts. Una parte inicial de cada script va a revisar si los paquetes requeridos ya están instalados, y en caso de detectar su ausencia, descargará e instalará los paquetes requeridos para el correcto funcionamiento de cada herramienta.
• Los scripts han sido ajustados para realizar los mismos procesos ya conocidos de cada herramienta, sin tener problemas por la descatalogación de los paquetes rgdal, rgeos y maptools.

Adicionalmente, la herramienta GEOQUAL se ajustó en dos sentidos, actualizando la herramienta anterior, e introduciendo una nueva herramienta GEOQUAL, con grandes ventajas respecto a la original. Sobre estas nuevas características de GEOQUALv2 (así se llama la nueva herramienta GEOQUAL) se publicará prontamente una nota en la web de las herramientas. Es importante tener en cuenta que la inclusión de la nueva GEOQUALv2 ha incrementado el tamaño del archivo .zip a descargar por parte del usuario que esté interesado, pasando de 2.9 Gb a casi 6.1 Gb.

Finalmente, y dado que durante los últimos 8 años desde que se lanzaron, las herramientas modela, mcompare y selecVIF, no hay evidencias de su uso por parte de los usuarios, las mismas han sido retiradas de la caja de herramientas, para hacer un poco más ligero el instalador en vista del incremento en Gb debido a la nueva GEOQUALv2.

Esperamos que todos los usuarios CAPFITOGEN3 sean beneficiados con esta actualización mayor de las herramientas. Este esfuerzo para poner al día las herramientas CAPFITOGEN3 y disponibilizar su apoyo a las actividades de conservación de la agrobiodiversidad, ha sido parcialmente posible gracias al proyecto BioDT (Biodiversity Digital Twins https://biodt.eu/).